выделяется ли окончание в изменяемых частях речи

Нулевое окончание - это такое окончание, которое материально не выражено. Впервые идею о нулевом окончании выразил выдающийся лингвист Иван Александрович Бодуэн де Куртенэ, затем его поддержал Филипп Федорович Фортунатов, который утверждал, что грамматическая форма может быть образована отсутствием аффикса.

Конечно, выделяется. Например, в прилагательных или причастиях(деревянный,деревянная).А в неизменяемых не выделяется( деепричастие, наречие).