Обочначьте причастный оборот, и раставьте запятые.
Было что-то необыкновенно привлекательное в этом оборванном деревенском пастушке с холщовой торбой в его заросшей голове похожей на саломенную крышу маленькой избушки в его синих ясных глазах.

Было что-то необыкновенно привлекательное в этом оборванном деревенском пастушке с холщовой торбой, в его заросшей голове, похожей на соломенную крышу маленькой избушки, в его синих ясных глазах.