Какая правильная расстановка знаков? И почему?
По бокам, до самых дверей росли совершенно невысокие кустики, отчётливо напоминавшие форму куба; как-то я порыскала возле них и убедилась, что они расположены не просто так, по тычке основателя, эти квадратики – шахматная доска, вот только расположены далековато друг от друга.

Кто аффтар шыдевра? Што такое "совершенно невысокие кустики"? Два раза "расположены" – тоже совершенно великолепно.

По бокам, до самых дверей, (уточняющее обстоятельство обособляется с двух сторон) росли совершенно невысокие кустики, отчётливо напоминавшие форму куба. (Здесь явно начинается новое предложение). Как-то я порыскала возле них и убедилась, что они расположены не просто так, по тычке основателя, эти квадратики – шахматная доска, вот только расположены далековато друг от друга.

раз-два-три - елочка, гори!