При фонетическом разборе слова ЧУВСТВА возник вопрос
в произношении [ч й у с т в а] либо [ч у с т в а]

нет, вопрос состоит в другом

возможно ли, что у трансформируется в ю далее по разложению [й у]

Гласные Е, Ё, Ю, Я обозначают два звука в том случае, когда: - стоят после гласной, например: маяк – [я] обозначает два звука, так как стоит. после гласного А, значит в слове маяк – 4 буквы, 5 звуков. правилко)

В транскрипции не используют "ю". Обычно пишут [й'у]. Вы это хотели узнать?

Второй вариант правильный. В - непроизносимая согласная в данном случае

чуства - у обозначает два звука,когда стоят  после гласной