почему растение-целостный организм?

Да, растение состоит из нескольких составляющих, но оно действительно является целостным, так как каждая составляющая не может жизнедействовать самостоятельно и, в свою очередь, растение без какой-либо одной составляющей жить не сможет.

Например, при поможи корня растение получает воду и питательные вещества, при помощи листьев растение получает воздух, при помощи цветков растение размножается. 

Все части растения существуют не сами по себе, а взаимосвязанно. Корень, стебель, листва, цветки и плоды - не могут функционировать сами по себе. И гибель, или наоборот чрезмерное развитие какой-либо одной части ведет к необратимым изменениям в других частях.

   Например, если чрезмерно  насытить почву  удобрениями, это приведет для корнеплодов к увеличению лиственной массы в ущерб развитию корнеплода.