Кукушкин лен, также как и остальные высшие растения, различается от водорослей тем, что у него сегментированная структура тела, а у водорослей тело не разделена на разные части. То есть у кукушкина льна тело делется на стебель, ризоиды, листья, спорангия, каждая из которых имеет определённую функцию, и эта функция не может повторится другим органом. А у водорослей все тело состоит из одинаковых клеток, и они все отвечают и за кормление, и за размножения.