Чтобы выяснить какой же корень в слове юбилей необходимо подобрать как можно больше однокоренных слов. Например: юбилейный, предъюбилейный, юбилеем, юбилею, юбилеи, юбиляр. Как видно неизменяемая часть слова это \"юбил\". Получается что корнем слова \"Юбилей\" будет - юбил