В Трудовом кодексе РФ, в частности, записано, что трудовой договор с работником может быть расторгнут работодателем в случае появления работника на работе в нетрезвом состоянии, в состоянии алкогольного, наркотического или иного токсического опьянения. Такая же мера может быть применена к работнику в случае прогула без уважительных причин, к которому относится и отсутствие на работе более четырёх часов подряд в течение рабочего дня. Выскажите своё мнение, почему к работнику, который, опоздав, всё же явился на своё рабочее место, применяется такая же мера, как и к прогульщику.

Если "опоздал" менее,  чем   на  4 часа, то не применяется

потому что работа это не отдых. устраиваясь на работу человек обязуется выполнять указанные работодателем правила, в том числе и график рабочего дня.