какой корень у слова вынуть?

Слов без корней не бывает. Единственным исключением в русском языке является глагол вынуть, в котором выделяется приставка вы-, суффикс -ну- и суффикс инфинитива -ть. В результате исторических изменений сегодня слово вынуть осталось без корня.

вы- приставка, корень нулевой, -ну- суффикс, -ть(окончание, по некоторым программам суффикс)

однокоренные вынимать - появляется корень

Вы -приставка,ут окончание,получается,н только

Вын-корень, у-суф, ть-окончание