Клюква-последняя ягода в сентябре. Напишите основу.

Последняя вообще прилагательное, к основе не относится, это определение будет, второстепенный член предложения.

Клюква -- ягода.Клюква - подлежащее, а ягода - сказуемое, выраженное существительным.